Je rok 1867 a slavný mořský biolog profesor Aronnax je vyzván válečným námořnictvem, aby prozkoumal tajemnou mořskou nestvůru, která v Atlantském oceánu poškodila a potopila zaoceánský parník Scotia. Aronnax souhlasí s expedicí, ale už ne s tím, aby se jí zúčastnila jeho Sophie, také výborný mořský biolog. Dívka se proto převlékne za muže a vetře se na loď jako otcův asistent. A protože jde o současnou hollywoodskou verzi, nemůže chybět láska. To znamená, že se Sophie zamiluje, a to samozřejmě do statného Neda Landa. Když Aronnax vypátrá netvora a Ned se ho pokusí harpunovat, obluda narazí do lodi a náraz vymrští Aronnaxe, Sophii a Neda přes palubu. Ke svému úžasu trojice zjistí, že netvor je podmořský člun, kterému velí kapitán Nemo. Pozve je na palubu, ale současně je varuje, že pokud vstoupí, nebudou moci odejít. A pak už se před Aronnaxem a jeho dcerou otevře pohádkový svět mořských hlubin.